aillarionov: (Default)
[personal profile] aillarionov
Накопленная информация позволяет сделать вывод о том, что в настоящее время мир имеет дело, по меньшей мере, с двумя весьма различающимися типами коронавируса SARS-CoV-2 – «восточно-азиатским» и «европейским». С биологической точки зрения, разновидностей коронавируса, естественно, гораздо больше. Но внимание большинства человечества в ближайшее время будут привлекать, очевидно, прежде всего именно эти два типа.

1. Биологический подход
В течение последних месяцев микробиологи, вирусологи, филогенетики, специалисты в других областях биологических наук ведут беспрецедентную работу по выявлению мутаций коронавируса и идентификации его многочисленных версий. По последним данным, обнаружено не менее шести тысяч его разновидностей. Учитывая скорость роста безостановочно «кустящегося» эволюционного дерева коронавируса, это означает, что сейчас появляется не менее 100 его вариантов ежедневно. В подавляющем большинстве случаев их отличия друг от друга интересуют лишь узкий круг специалистов.

Большинство же жителей планеты заитересованы прежде всего в понимании того, как разные виды коронавируса воздействуют на человека, есть ли между ними различия, и если да, то в чем.

Разработчики наиболее полной базы образцов коронавируса практически в режиме реального времени создают «портрет» эволюционного дерева коронавируса.


Им также удалось выявить несколько основных геномных кластеров коронавируса и локализовать их на географической карте.


С точки же зрения взаимодействия коронавируса с человеческой популяцией можно выделить два его основных типа, какие по месту их наиболее яркого проявления можно назвать соответственно «восточно-азиатским» и «европейским». Есть несколько параметров во взаимодействии коронавируса с человеком, количественные значения которых позволяют идентифицировать заметные различия между двумя этими типами.

2. Периодизация эпидемии
Исторически первым был «восточно-азиатский» тип коронавируса. Первым проявлением болезни официально считается случай, зарегистрированный в Ухане 1 декабря 2019 г. Однако газета South China Morning Post со ссылкой на находящиеся в ее распоряжении документы правительства КНР утверждает, что первой пациенткой была 55-летняя женщина, заболевшая еще 17 ноября 2019 г. Тем не менее и она, скорее всего, не была «нулевым пациентом».

По данным той же газеты к концу 2019 г. в Ухане было уже 266 инфицированных.

В течение первых (как минимум) 57 дней – с 17 ноября 2019 года по 12 января 2020 года – случаи заболевания коронавирусной инфекцией регистрировались только в Китае. Этот первый период распространения инфекции с 17 ноября 2019 г. по 12 января 2020 года можно назвать китайским.

В период с 13 января по 1 февраля 2020 г. вирус из Уханя был обнаружен еще в 25 странах мира – Таиланде, Японии, Южной Корее, Тайване, Камбодже, на Филиппинах, в Гонконге, Сингапуре, Вьетнаме, Малайзии, Индии, Шри-Ланке, Непале, ОАЭ, Австралии, Канаде, США, Великобритании, Франции, Испании, Италии, Германии, Швеции, Финляндии, России. Иными словами, в течение этих 20 дней вирус завоевывал в среднем по 1,3 новой страны ежедневно. К концу этого периода на 10 восточно-азиатских стран пришлось 73,5% от общего числа всех случаев в мире (без Китая). Поэтому второй период распространения инфекции (с 13 января по 1 февраля 2020 г.) можно назвать восточно-азиатским.

1 февраля в казавшемся безостановочном мировом наступательном походе коронавируса внезапно возникла пауза, которая длилась почти три недели – до 20 февраля. После быстрого захвата ряда стран коронавирус как будто бы «уснул». Казалось, он «передумал» завоевывать новые пространства. Во время этой почти трехнедельной паузы произошли лишь два изолированных заражения (по одному человеку в Бельгии и Египте). Этот третий период можно так и назвать – глобальная пауза. В течение этого периода удельный вес восточно-азиатских случаев заражений в общемировом числе (без Китая) увеличился до 85,1%, европейских – снизился с 13,2 до 8,1%.

Глобальная пауза в распространении коронавируса, февраль 2020 г.


Пауза в коронавирусном наступлении была прервана 20 февраля. В этот день о появлении первых двух больных объявил Иран. Два дня спустя, 22 февраля, на расстоянии тысяч километров друг от друга практически одновременно произошли два эпидемических взрыва: один – в Иране, другой в Италии. В последующие дни и недели европейский театр стал главным направлением наступления коронавируса. Удельный вес Европы в общемировом числе случаев (без Китая) вырос с 6,4% 22 февраля до 55,5% 21 марта. Поэтому можно говорить о том, что с 20 февраля начался четвертый период эпидемии – европейский взрыв, быстро перешедший в мировую пандемию.

Колоссальная по длительности для эпидемической обстановки и пока не вполне объяснимая временная пауза в межстрановом распространении вируса длительностью почти в три недели позволяет четко отделить друг от друга два временных кластера взрывного эпидемического поведения и, следовательно, выделить четыре основных периода пандемии:

1) китайский (17 ноября 2019 г. – 12 января 2020 г.);
2) восточно-азиатский взрыв (13 января – 1 февраля 2020 г.);
3) глобальная пауза (2 – 19 февраля);
4) европейский взрыв (с 20 февраля), быстро перешедший в общемировую пандемию.

3. Изменения в географии
Эпидемические извержения, начавшиеся в Иране и Италии 20-22 февраля, ознаменовали собой начало нового периода, качественно отличающегося от предыдущего периода с относительно «плавным» распространением коронавируса.

Прежде всего резко увеличилось число стран, затронутых эпидемией. Если за 19 дней периода глобальной паузы число стран, затронутых эпидемией, увеличилось лишь на две, то в последующие 19 дней на стадии европейского взрыва оно возросло на 79.

Таблица 1. Изменения в географии эпидемии по трем периодам


Во-вторых, географический центр пандемии переместился из Восточной Азии в Европу. Если в течение 19 дней глобальной паузы удельный вес Восточной Азии в общем числе случаев в мире (без Китая) увеличился с 72,8 до 83,4%, то в течение первых 19 дней периода европейского взрыва он упал до 26,5%. В то же время за 19 дней стадии европейского взрыва удельный вес Европы в общем числе случаев в мире (без Китая) вырос с 8,1 до 42,8%.

4. Скорость распространения
Во время четвертого периода эпидемии – европейского взрыва – радикально выросла скорость распространения инфекции. Значение базового коэффициента репродукции R0, определенное по китайским данным на уровне 2,2, в Европе составляло в первые недели взрыва 4,0 и, по некоторым сообщениям, достигало даже 5,7.

Если за 19 дней глобальной паузы с 1 по 20 февраля общее число случаев инфицирования коронавирусом в мире (без Китая) увеличилось в 3,4 раза (средний темп прироста составлял 6,7% в день), то в последующие 19 дней (с 20 февраля по 10 марта) оно возросло в 63 раза (средний темп прироста увеличился до 24,4% в день).

Таблица 2. Скорость распространения инфекции в мире (без Китая) по трем периодам


5. Разное поведение «старого» и «нового» типов вирусов
То, что в Европу после почти трехнедельной глобальной паузы в дополнение к «старому» варианту коронавируса прибыл его «новый» тип, стало заметным по практически всем изменившимся количественным характеристикам его взаимодействия с человеческой популяцией. В восьми европейских странах (Великобритании, Франции, Испании, Италии, Германии, Швеции, Финляндии, Бельгии), в которых первые случаи заболеваний «восточно-азиатским» типом коронавируса были зарегистрированы до 4 февраля, распространение инфекции с 20-22 февраля радикально ускорилось.

Таблица 3. Скорость распространения инфекции в странах трех регионов мира, в которых были зарегистрированы случаи до 4 февраля, по двум периодам


Если за 19 дней глобальной паузы число случаев в Европе выросло в 2,1 раза, то за следующие 19 дней европейского взрыва – почти в 313 раз. Если на стадии глобальной паузы средний прирост числа заболевших в Европе составлял 4% в день, то в последующие 19 дней – более чем 35% в день.

В то же время в 10 восточно-азиатских странах (Таиланде, Японии, Южной Корее, Тайване, Камбодже, Филиппинах, Гонконге, Сингапуре, Вьетнаме, Малайзии) распространение инфекции на стадии европейского взрыва не происходило с такой катастрофической скоростью, как в Европе. Скорость распространения коронавирусной инфекции повысилась, естественно, и в этом регионе, но не так драматично, как в европейских странах. Если за 19 дней стадии глобальной паузы число случаев в Восточной Азии выросло в 4,1 раза, то за следующие 19 дней – в 20,5 раза.

Следует заметить, что в Австралии и Канаде, странах по подавляющему большинству своих социальных, экономических, политических, даже генетических характеристик более близких к Европе, нежели к Восточной Азии, рост числа случаев инфицирования на стадии глобальной паузы проходил по сценарию, похожему для всех трех регионов, а на стадии европейского взрыва – похожему на восточно-азиатский вариант.

На стадии глобальной паузы число случаев инфекции выросло:
в Восточной Азии – в 4,1 раза,
в Австралии и Канаде – в 1,8 раза,
в Европе – в 2,1 раза.

На стадии европейского взрыва число случаев инфекции выросло:
в Восточной Азии – в 20,5 раза,
в Австралии и Канаде – в 7,7 раза,
в Европе – в 312,9 раза.

Кажущаяся смена «парадигмы» в реакции на эпидемию при переходе от одной ее стадии к другой в Австралии и Канаде произошла не потому, что 20-22 февраля 2020 года эти две страны и эти два общества одновременно, как по команде, внезапно сменили свою восприимчивость к коронавирусу, так сказать, европейского типа на восприимчивость к нему, так сказать, восточно-азиатского типа и тем самым избежали наиболее трагического сценария развития эпидемии. Естественно, это невозможно.

Разгадка этой загадки заключается в том, что на стадии восточно-азиатского взрыва во все 27 стран первой волны (25 стран до 1 февраля, плюс Бельгия и Египет несколькими днями позже) распространился восточно-азиатский тип коронавируса.

На стадиях глобальной паузы и европейского взрыва этот тип коронавируса продолжал господствовать и в Восточной Азии, и в Австралии и в Канаде, и в Европе.

А вот на стадии глобальной паузы в Европу проник и в ходе последовавшего затем европейского взрыва вытеснил своего предшественника новый тип коронавируса, существенно отличающийся от своего старшего родственника количественными характеристиками – контагиозностью, скоростью распространения, заболеваемостью, смертностью, летальностью. В дальнейшем этот, европейский, тип коронавируса, из Европы распространился, очевидно, и в некоторые другие регионы мира.

6. Количественные характеристики двух типов коронавируса
Визуально поведение двух типов коронавируса можно наблюдать на примере распространения инфекции в двух частях мира – Восточной Азии и в остальной части мира. Для сопоставимости результатов на нижеследующих графиках представлены страны, одновременно удовлетворяющие двум критериям:
1) в них зарегистририровано 100 и более случаев заражений;
2) с начала стадии эпидемического взрыва в них прошло не менее 28 дней.

По горизонтальной оси на графиках отложены календарные даты, по вертикальной – число заболевших на 1 млн жителей.

Заболеваемость на 1 млн. жителей в двух группах стран на 0-й день с начала стадии взрыва


Заболеваемость на 1 млн. жителей в двух группах стран на 7-й день с начала стадии взрыва


Заболеваемость на 1 млн. жителей в двух группах стран на 14-й день с начала стадии взрыва


Заболеваемость на 1 млн. жителей в двух группах стран на 21-й день с начала стадии взрыва


Заболеваемость на 1 млн. жителей в двух группах стран на 28-й день с начала стадии взрыва


Как видно по представленным графикам, между двумя группами стран – «расширенной Восточной Азией» (к которой относятся, кроме собственно восточно-азиатских стран, также и Австралия и ОАЭ) и остальным миром – пролегает широкая временная полоса (период между 31 января и 19 февраля), отделяющая начало стадий эпидемического взрыва в странах одной группы от начала стадий взрыва в странах другой. В странах «большой Восточной Азии» (вместе с Австралией и ОАЭ) стадии взрыва начались в период между 21 и 30 января. В группе стран остального мира стадии взрыва начались с 20 февраля. Ни в одной стране мира стадия взрыва не началась в промежутке между 31 января и 19 февраля. Почему в развитии эпидемии наступила эта глобальная пауза, почему она сохранялась в течение трех недель, еще предстоит разобраться.

Если рассматривать средние значения по каждой из этих групп стран целиком, то видно, что показатели заболеваемости в расчете на 1 млн. жителей в группе стран остальной части мира даже накануне стадии взрыва (в нулевой день) были несколько выше, чем в группе стран Восточной Азии. Об этом свидетельствует слабый положительный наклон линии тренда на самом первом из этой серии графиков.

С течением времени – при переходах от 0-го дня последовательно к 7-му, 14-му, 21-му, 28-му дням стадии взрыва угол наклона линии тренда увеличивается, что свидетельствует о том, что заболеваемость в странах остальной части мира (во многих из которых распространился «европейский» тип коронавируса) увеличивалась заметно быстрее, чем заболеваемость в восточно-азиатской группе стран (в которой по-прежнему продолжал действовать «восточно-азиатский» тип вируса).

Если графически изобразить разницу в скорости нарастания заболеваемости в этих двух группах стран, то получается следующая картина.

Заболеваемость на 1 млн. жителей в двух группах стран с начала стадии взрыва


Как видно, разрыв в уровнях заболеваемости на 1 млн. жителей между группами стран, находящимися под воздействием двух разных типов коронавируса, оказывается огромным и к тому же постоянно нарастающим. Не менее впечатляющей является и разница между теми же группами стран в динамических показателях смертности.

Смертность на 1 млн. жителей в двух группах стран с начала стадии взрыва


Основные количественные показатели воздействия двух типов коронавируса на человеческую популяцию можно свести в следующую таблицу.

Таблица 4. Заболеваемость, смертность, летальность в двух группах стран с двумя типами коронавирусов на 28-й день с начала стадии эпидемического взрыва по состоянию на 13 апреля 2020 г.


Нетрудно видеть, что показатели заболеваемости и смертности в двух группах стран различаются на два порядка: европейский тип коронавируса по сравнению с восточно-азиатским на 28-й день после начала стадии взрыва приводит к более высоким уровням: заболеваемости – в среднем в 97 раз, смертности – в 402 раза.

Поскольку каждая из этих групп стран – и «восточно-азиатская» и «остальная часть мира» – оказываются по своему составу весьма разнородными, поскольку они включают в себя страны с разными географическими, социальными, экономическими, политическими показателями, с весьма различным населением по биологическим и медицинским характеристикам, с заметно различающимися государственными ответами на эпидемию, столь значительные количественные различия между ними, причем возрастающие со временем, могут быть объяснены, очевидно, только одной причиной. Эта причина кроется не только и не столько в различии уровней восприимчивости населения этих стран к коронавирусу, не только в реакции общества и не в характере государственной политики, проводимой в ответ на эпидемию. Эта причина заключается в природе самой инфекции, в наличии, минимум, двух ее различных типов.

Следует подчеркнуть, что оба типа инфекции очень опасны. Они оба смертельны.
Но их отличие друг от друга заключается, в частности, в том, что второй тип инфекции имеет по сравнению с первым типом более высокие показатели:
- летальности – почти втрое;
- заболеваемости – примерно в 100 раз;
- смертности – примерно в 400 раз.

7. Предварительные выводы
Из приведенных выше соображений следует несколько выводов.

Во-первых, для общества и властей каждой страны необходимо понимать, с каким именно типом коронавируса они столкнулись.

Во-вторых, общественная и политическая реакция на эпидемии, вызываемые коронавирусами разных типов, по определению не может быть одинаковой. Меры, успешно проявившие себя в деле борьбы с относительно более «мягкой» эпидемией, могут оказаться совершенно недостаточными и откровенно непригодными в деле сопротивления более «жесткой» эпидемии.

В-третьих, сопоставление государственных мер по их эффективности, а также эпидемических результатов в странах, оказавшихся под ударами коронавирусов разных типов, не имеет никакого смысла. Это все равно что сравнивать насморк с холерой.

В силу сказанного эффективность тех или иных противоэпидемических мероприятий следует анализировать в пределах очага действия конкретного типа коронавируса. Например, успех или неудача КНР (при анализе для этой страны достоверных данных) должны оцениваться не в сравнении с европейскими странами, а в сравнении с членами «восточно-азиатской группы» – Тайванем, Южной Кореей, Японией, Австралией, Вьетнамом.

Поскольку большая часть европейских стран в последнее время оказалась под ударом т.н. «европейского» типа коронавируса, то эффективность противоэпидемических мероприятий в них имеет смысл оценивать не с деятельностью властей КНР, Южной Кореи, Тайваня или даже Австралии, а лишь в сравнении друг с другом.

Дальнейшее изучение проблемы, не исключено, позволит говорить о бОльшем числе типов  коронавируса, что поможет уточнить сделанные выше выводы.
Page 1 of 2 << [1] [2] >>

Date: 2020-04-15 07:25 pm (UTC)
From: [identity profile] lj-frank-bot.livejournal.com
Hello!
LiveJournal categorization system detected that your entry belongs to the following categories: Коронавирус (https://www.livejournal.com/category/koronavirus?utm_source=frank_comment), Медицина (https://www.livejournal.com/category/medicina?utm_source=frank_comment).
If you think that this choice was wrong please reply this comment. Your feedback will help us improve system.
Frank,
LJ Team

?

Date: 2020-04-15 08:10 pm (UTC)
From: [identity profile] suslik1971 (from livejournal.com)
Ученые объясняют превращение "насморка" в "холеру" естественными мутациями вируса?

Date: 2020-04-15 10:10 pm (UTC)
From: (Anonymous)
Если верно, что есть «холера» и «насморк», и окажется, что насморк не мог перерасти в холеру, то это будет очень.... скажем, сильным аргументом, в пользу того, что кто-то умышленно убил сотни тысяч, а скорее всего, и миллионы, людей./Адам

(no subject)

From: [identity profile] suslik1971 - Date: 2020-04-16 01:06 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: (Anonymous) - Date: 2020-04-16 10:11 am (UTC) - Expand

внутривидовая передача

From: [identity profile] suslik1971 - Date: 2020-04-17 10:26 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] leonid-shvedov.livejournal.com - Date: 2020-04-16 11:35 am (UTC) - Expand
From: [identity profile] onlyfreedigits.livejournal.com
К выводам напрашивается вопрос. Кто является "нулевым" пациентом "европейского" типа вируса и каким образом произошло заражение?
Я имею ввиду этот маленький кружочек над Миланом по ссылке из основного поста
Screenshot 2020-04-15 at 22.15.27.png
(ссылка на страницу с настроенным фильтром Тип мутаций A2a)

Ну и до кучи побрейнстормлю.
- Не является ли первая часть короновирусного балета операцией прикрытия второй части?
- Является ли затягивание принятия мер со стороны ВОЗ операцией прикрытия?
- Будет ли третья часть короновирусного балета и насколько эта часть будет более смертоносной
- Снова давайте спросим, что делали российские военные вирусологи в Бергамо?
- Что же на самом деле произошло в Новосибирске в сентябре 2019 года?
- 72 тыс тестов, проведенным в Украине (по другим данным 39,084) это глупость или измена для подготовки к следующей стадии?

Ну и в дополнение А.А. Пионтковский снова настаивает о человеческой природе вируса.
https://youtu.be/C-qn-vQCyfc?t=4824
"Он был создан в 2014 году в Университете Северной Каролины. Была громадная статья в Nature. ... we generated himera virus.. И дальше вся эта команда вместе с Ли переехала в Ухань.... Ухань и Вектор это два крупнейших центра по бак... Они обязаны были читать и повторить эти статьи в Новосибирске. Для одного из лучших институтов это ничего не стоило. Т.е. в 2019 году он был в Новосибирске и в Ухане..."
Edited Date: 2020-04-15 08:40 pm (UTC)
From: [identity profile] redbut.livejournal.com
Если это верно, то похоже что США сначала подверглась удару восточно-азиатского типа (западные штаты - Калифирния и Вашингтон), а зятем - европейского (восточое побережье, в первую очередь Нью-Йорк и Нью-Джерси)
https://www.worldometers.info/coronavirus/country/us/

(no subject)

From: [identity profile] sergvlkv.livejournal.com - Date: 2020-04-16 04:23 am (UTC) - Expand

Date: 2020-04-15 08:19 pm (UTC)
From: [identity profile] afanasjev77.livejournal.com
Нет никакого азиатского и европейского ковида, вот летальность по возрастам:
Image
Корея ничем не отличается от Европы, а для Китая это данные на середину эпидемии когда у них было в два раза меньше зараженных и в три раза меньше умерших, то есть сейчас они тоже не сильно от Европы отличаются.
По скорости распространения можно например посмотреть сколько дней прошло с того, как появилось первая тысяча зараженных и до того как они превысили 10000. Для Китая это 7 дней, для Италии - 10, Испания - 8, США - 8, Германия - 10, Франция - 11.

передача в европе

Date: 2020-04-15 10:34 pm (UTC)
From: [identity profile] kactycb.livejournal.com
Но распространяется вирус шире в целующихся странах - Италия, Испания, Франция, Бельгия..
То же должно быть и в Латинской Америке.
В Азии же культура уже несколько другая- уже прошедшая обкатку предыдущим САРСом.
США же - культурный котел. Там и итальянцы, и латинос..

Re: передача в европе

From: (Anonymous) - Date: 2020-04-16 08:38 am (UTC) - Expand

Бывший Джон_н_Доу

From: (Anonymous) - Date: 2020-04-16 06:42 pm (UTC) - Expand

Источник данных?

From: [identity profile] aillarionov.livejournal.com - Date: 2020-04-16 12:35 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: (Anonymous) - Date: 2020-04-16 12:46 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: (Anonymous) - Date: 2020-04-16 09:37 pm (UTC) - Expand

Date: 2020-04-15 08:37 pm (UTC)
From: [identity profile] livejournal.livejournal.com
Hello! Your entry got to top-25 of the most popular entries of Russia in LiveJournal! Learn more about LiveJournal Ratings in FAQ (https://www.dreamwidth.org/support/faqbrowse?faqid=303).
From: (Anonymous)
У описываемой истории есть две составляющие ее части. Первая часть - это история о мутации вируса, в результате которой из умеренно агрессивного образовался сильно агрессивный. И с
этой частью все более-менее ясно. История стандартная, выживает "сильнейший", так сказать. Т.е. с появлением агрессивной версии вируса его устаревший собрат, видимо, отошел в тень.

Однако, есть еще и вторая часть. По чистой логике теперь этот, агрессивный, собрат - должен вытеснить менее агрессивного повсюду. Ясно что не сейчас - сейчас везде карантин, но - при первой же возможности. Разница в заболеваемости в 100 раз - вещь настолько сильная, что достаточно одному европейскому носителю нового вируса чихнуть в китайском аэропорту, и "славная" история его азиатского прародителя довольно быстро окажется сданной в архив. Примерно как африканская пчела вытесняет европейскую.

Не знаю, будет ли у нас "шанс" проверить эту гипотезу - т.е. будет ли в Азии новый всплеск. Но если будет - а вирус так и останется там азиатским, то о чем это будет говорить?

По-моему, это хороший вопрос:) Конечно в той мере в какой в этой истори вообще может быть что-либо "хорошего". Но для чистой науки - все-таки хороший.

Впрочем, даже и без второго взрыва, ведь не все же переболели. Поэтому, по идее, даже в скрытой, неявной, неяркой форме теперь по всему миру должна разойтись именно зараза европейского типа.

Если конечно здесь вообще речь идет только лишь о чистой медицине:) Михаил.
From: [identity profile] onlyfreedigits.livejournal.com
>этой частью все более-менее ясно. История стандартная, выживает "сильнейший", так сказать

насколько я помню, с MERS произошло ровно наоборот
Edited Date: 2020-04-15 10:16 pm (UTC)

Within vs between variation

Date: 2020-04-15 09:07 pm (UTC)
From: [identity profile] rostix.livejournal.com
Поскольку каждая из этих групп стран – и «восточно-азиатская» и «остальная часть мира» – оказываются по своему составу совершенно разнородными, поскольку они включают в себя страны с совершенно разными географическими, социальными, экономическими, политическими показателями, с весьма различным населением по биологическим и медицинским характеристикам, с замето различающимися государственными ответами на эпидемию, столь значительные количественные различия между ними, причем возрастающие со времени, могут быть объяснены, очевидно, только одной причиной. ... Эта причина заключается в природе самой инфекции, в наличии, минимум, двух ее различных типов.

Совсем не очевидно почему лишь одна причина.

То, что каждая из этих групп стран по-своему разнородна, - понятно. Это within variation. Вы же, Андрей Николаевич, если я правильно понимаю, делаете упор на between variation, то есть на разницу между двумя группами. Можно привести много факторов, по которым эти две группы отличаются друг от друга. И "природа самой инфекции" - это лишь один из возможных факторов.

Date: 2020-04-15 09:38 pm (UTC)
From: [identity profile] livejournal.livejournal.com
Hello! Your entry got to top-25 of the most popular entries in LiveJournal! Learn more about LiveJournal Ratings in FAQ (https://www.dreamwidth.org/support/faqbrowse?faqid=303).

Date: 2020-04-15 09:45 pm (UTC)
From: [identity profile] olegskvortsov.livejournal.com

Пишут о трех штаммах вируса:

In a phylogenetic network analysis of 160 complete human severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-Cov-2) genomes, we find three central variants distinguished by amino acid changes, which we have named A, B, and C, with A being the ancestral type according to the bat outgroup coronavirus.The A and C types are found in significant proportions outside East Asia, that is, in Europeans and Americans. In contrast, the B type is the most common type in East Asia, and its ancestral genome appears not to have spread outside East Asia without first mutating into derived B types, pointing to founder effects or immunological or environmental resistance against this type outside Asia.

https://www.pnas.org/content/early/2020/04/07/2004999117

И что привлекает внимание:

Cluster B is striking with regard to mutational branch lengths: While the ancestral B type is monopolized (26/26 genomes) by East Asians, every single (19/19) B-type genome outside of Asia has evolved mutations. This phenomenon does not appear to be due to the month-long time lag and concomitant mutation rate acting on the viral genome before it spread outside of China (Dataset S1, Supplementary Table 2). A complex founder scenario is one possibility, and a different explanation worth considering is that the ancestral Wuhan B-type virus is immunologically or environmentally adapted to a large section of the East Asian population, and may need to mutate to overcome resistance outside East Asia.


Date: 2020-04-15 10:50 pm (UTC)
From: [identity profile] aillarionov.livejournal.com
https://twitter.com/arambaut/status/1248387395201847296

Пишут о трех штаммах вируса

From: (Anonymous) - Date: 2020-04-16 08:48 am (UTC) - Expand

Date: 2020-04-15 09:48 pm (UTC)
From: (Anonymous)
Сюжет фантастического рассказа
https://m.facebook.com/story.php?story_fbid=1514334705411567&id=100005051557642

КОВИД-чок

Date: 2020-04-16 08:37 am (UTC)
From: [identity profile] bayantheone.livejournal.com
завораживающая версия, но тогда зачем же власти государства В секретят информацию, не смотря на то, что это не в их интересах?

и атака ожидалась бы также против страны U, и трёх стран региона P, но в них ситуация пока не настолько тяжёлая, как в других странах
Edited Date: 2020-04-16 09:15 am (UTC)

(no subject)

From: (Anonymous) - Date: 2020-04-16 05:52 pm (UTC) - Expand

Коронавирус

From: [identity profile] Владимир Щукин - Date: 2020-04-18 04:50 am (UTC) - Expand
From: (Anonymous)
Ю.Швец о Российской природе происхождения коронавируса

https://youtu.be/C-qn-vQCyfc?t=3697

Date: 2020-04-15 10:24 pm (UTC)
From: [identity profile] serg-private.livejournal.com
Летальность в Германии сильно отличается от других стран Европы

Замечания

Date: 2020-04-15 10:26 pm (UTC)
From: [identity profile] 14-sonde-sic.livejournal.com
Не очень понятны графики "Заболеваемости на 1 млн ... на n день ...":
во-первых по ординате откладывается явно логарифм удельного инфицирования, а не само число зараженных на миллион; во-вторых если использовался метод статистического уточнения, то непонятно, что на ранних графиках делают выборочные значения по поздним числам; в-третьих низкая корреляция ставит под сомнение правомерность линейной оценки и, следовательно, экспоненциальную форму самой кривой удельного инфецирования. Последние 2 графика вопросов не вызывают, можно было их уточнить логарифмическим масштабом.
Edited Date: 2020-04-16 12:05 am (UTC)
From: [identity profile] stanislav samolenkov (from livejournal.com)
Скорость распространения вируса сильно зависит от восприимчивости населения к вирусу - какой % населения будет размножать вирус, если он попадет в организм (в клетки эпителия). Этот % может в разы отличаться в разных регионах мира. Второе условие - перекрестный иммунитет между разными коронавирусами (у человека есть 4 своих старых коронавируса, циркулирующих в человеческой популяции). Если в каком-то регионе сезонные ОРВИ вызываются больше разными человеческими коронавирусами, там там есть у части населения, может до одной трети населения) иммунитет к этому новому коронавирусу, пусть не такой сильный как у тех, кто им переболевает, но какой-то есть. Возможно именно это в большей степени (наряду с вакцинацией БЦЖ) определяет межстрановые различия и межрегиональные различия. Смотрите, например, в южной части Калифорнии очень низкая заболеваемость.

Date: 2020-04-15 11:22 pm (UTC)
From: [identity profile] shurikaa.livejournal.com
Одно что-то никак не могу понять... А как с этим всем коррелируется выысказанная ранее мысль о прививке БЦЖ, как защите от короновируса?

Date: 2020-04-15 11:52 pm (UTC)
From: (Anonymous)
Да просто. То, что прививка БЦЖ и вправду снижает смертность от коронавируса в несколько десятков раз, уже доказанный факт. Недавно читал новости, где один учёный из Америки провёл исследование в отношении более 170 стран, и пришёл к выводу, что в странах с обязательной прививкой вакцины БЦЖ, от коронавируса погибло 20 раз меньше людей.
Здесь объясняется другое. Почему в Австралии, к примеру, погибло только 63 человека при 6,4 тысячи заболевших (менее 1%), а в той же Англии 12 тысяч при 98 тысячах (более 12%). Две страны практически во всём идентичные друг другу. Объяснить эту разницу между ними сугубо предпринятыми мерами против эпидемии, навряд ли является возможным. Но если исходить, что в Англии «работает» один тип коронавируса, а в Австралии его более «милосердный» собрат другой, то двузначная разница становится понятной.

(no subject)

From: [identity profile] scholast.livejournal.com - Date: 2020-04-16 01:47 am (UTC) - Expand

(no subject)

From: (Anonymous) - Date: 2020-04-16 02:27 am (UTC) - Expand

Date: 2020-04-15 11:42 pm (UTC)
From: (Anonymous)
Существует и другое объяснение паузы в распространении вируса.
Пауза связана с эффективностью противоэпидемиологических мероприятий на начальной стадии когда все случаи инфекции были завозными и их было мало. Завозные случаи отслеживались, отслеживались так же близкие контакты второго и наверно третьего уровня через которые и идёт основное распространение вируса. Таким образом основной коэффициент распространенияинаверное удалось сделать даже меньше единицы. Китай в феврале так же взял ситуацию под контроль и завозных случаев было немного.
Но проблемы были неизбежны, кроме основных отслеживаемых контактов были и немногочисленные случайные заражения отследить которые не было возможности. После выхода за пределы отслеживаемых контактов инфекция получила экспоненциальное развитие но с очень низкой базы (единичные случаи заражения через случайные непредсказуемые контакты). Дополнительно ситуация усугублялась отсутствием возможности широкого тестирования лиц не имеющих очевидной связи с Китаем или известными инфицированными , неспецифичностью симптомов и достаточно длительным сроком развития заболевания.
Интересно отметить что в Китае так же имелось правде менее выраженное плато в развитии инфекции в начале января, связанное с локализацией инфекции на начальной стадии вокруг рынка, выявлением этого очага и связанных с ним напрямую или через контакты заболевших, и их изолированием.

Date: 2020-04-16 01:07 am (UTC)
From: [identity profile] fluorent.livejournal.com
Матчасть по вирусам - лекция Сергея Нетёсова. Что интересно:
1986—2010 — заведующий лабораторией молекулярной биологии РНК-вирусов в ГНЦ ВБ «Вектор».
1990—2007 — заместитель директора НПО (ГНЦ ВБ) «Вектор».
1995—2005 — директор НИИ молекулярной биологии ГНЦ ВБ «Вектор».
Утверждает, в частности, что вирус не утек, лекция, на мой взгляд, вполне грамотная.

Edited Date: 2020-04-16 01:19 am (UTC)

Date: 2020-04-16 06:49 pm (UTC)
From: [identity profile] onlyfreedigits.livejournal.com
Вот что докладчик приводит против версии проихождения вируса из лаборатории в Китае
Screenshot 2020-04-16 at 20.08.28.png
Маловато. И интересно, 80% чего от чего.

Вот его более ранняя лекция на тему
https://www.youtube.com/watch?v=P04oNGHciqs
Он упоминает, что от коронавирусов нет вакцины (!)
Также на 53:50 он упоминают статью, где на юге Казахстана ловили летучих мышей и искали у них короновирусы. Исследование было сделано совместно с китайскими учеными.

(no subject)

From: [identity profile] fluorent.livejournal.com - Date: 2020-04-16 09:01 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] fluorent.livejournal.com - Date: 2020-04-17 03:58 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] fluorent.livejournal.com - Date: 2020-04-17 07:15 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] onlyfreedigits.livejournal.com - Date: 2020-04-17 09:17 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] fluorent.livejournal.com - Date: 2020-04-17 09:39 pm (UTC) - Expand

репутация-с

From: [identity profile] onlyfreedigits.livejournal.com - Date: 2020-04-17 08:15 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] fluorent.livejournal.com - Date: 2020-04-17 11:07 pm (UTC) - Expand

Date: 2020-04-16 03:05 am (UTC)
From: (Anonymous)
А меня больше всего смущает количество заболевших и имевших контакты лидеров стран Запада (вроде еще были сообщения об Иране). Непропорционально большое количество, так и напрашивается мысль о целенаправленной охоте за ними. Ну, и не надо забывать о копании саботажа карантинных мероприятий, развернутой российскими спецслужбами за границами России (особо показательны призывы священников УПЦ МП в Украине).
From: (Anonymous)
Ancha Baranova.
"Коронавирус: хорошие новости" https://youtu.be/x6z7HhfV2FY?t=203

Date: 2020-04-16 05:36 am (UTC)
From: [identity profile] red-fox-alisa.livejournal.com

А может во время глобальной паузы вирус прошёлся из Азии в Европу через Россию? Чем ещё объяснить наличие антител у многих людей

Date: 2020-04-16 06:26 am (UTC)
From: (Anonymous)
этот тип коронавируса [«восточно-азиатский»] продолжал господствовать и .. в Канаде
--
it's questionable.
a lot of people returned to Quebec from France with {«европейский»] virus.
the slow reaction of the provincial government which did nothing to control that stream of spreading explains Quebec's current situation. moreover they failed to protect their care houses.

Date: 2020-04-16 07:19 am (UTC)
From: [identity profile] selennideras.livejournal.com
Уже в Китае и на начальной стадии было две разновидности вируса и именно разные по свойствам.Такое сообщение со ссылкой на китайскую прессу промелькнуло ещё ДО эпидемии в Европе.

Date: 2020-04-16 07:33 am (UTC)
From: (Anonymous)
Канадские ученые считают, что принести вирус человеку могли бродячие собаки, поедавшие летучих мышей:

"Согласно окончательному сценарию, коронавирус перешел от летучих мышей на бездомных собак, которые едят мясо летучей мыши. Затем, предположительно, сильный отбор против CpG в геноме вирусной РНК способствовал быстрой эволюции вируса в кишечнике и привел к снижению уровня CpG. Это позволило вирусу уйти от ZAP-опосредованного иммунного ответа человека и стать серьезным человеческим патогеном."

Date: 2020-04-16 09:19 am (UTC)
From: [identity profile] bayantheone.livejournal.com
любопытен способ охоты бродячих собак на летучих мышей, которые и на землю-то не садятся
собаки и сухопутных мышей не ловят, а тут летучие

возможно они ели дохлых летучих мышей, но всё же было бы неплохо понять механизм
Edited Date: 2020-04-16 09:27 am (UTC)

Ксеноцид

From: [identity profile] evgeniy-geniev.livejournal.com - Date: 2020-04-17 04:32 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] one-sergey.livejournal.com - Date: 2020-04-16 04:25 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] vladimir vershinin - Date: 2020-04-16 04:47 pm (UTC) - Expand

(no subject)

From: [identity profile] one-sergey.livejournal.com - Date: 2020-04-17 05:49 am (UTC) - Expand

Date: 2020-04-16 07:38 am (UTC)
From: (Anonymous)
А в РФ какой тип вируса? Все таки летальность не такая как в Италии и Испании

Date: 2020-04-16 11:32 am (UTC)
From: (Anonymous)
Оба. Китайский щедро раздавал пневмонию с бронхитами в Москве во второй половине декабря. В марте пришёл второй.

Вопрос автору

Date: 2020-04-16 07:45 am (UTC)
From: [identity profile] georg27.livejournal.com
Уважаемый автор!
Не кажется ли Вам, что представленные Вами три последних публикации содержат в себе серьезное внутреннее противоречие?

Поясню. В статьях, которые размещены в Вашем блоге, подымается вопрос о достоверности данных (о коронавирусе), исходящих из Китая. Как я понял из размещенных Вами материалов (три последние публикации), достоверность данных о "китайском" этапе распространения вируса - вызывает большие сомнения. Об этом же пишут и многие другие авторы.

Но если китайская статистика вызывает сомнения, то имеют ли смысл сделанные на ее основе обобщения? Как можно получить достоверный результат, строя выводы на базе недостоверных исходных данных?

Три статьи это данная статья и вот эти:
https://aillarionov.livejournal.com/1173817.html#cutid1
https://aillarionov.livejournal.com/1174131.html#cutid1
From: [identity profile] aillarionov.livejournal.com
В данном посте представлены результаты расчетов, в которых официальные данные Китая не используются.
Более того, обращено внимание на информацию, опубликованную SCMP, опровергающую официальные китайские данные.
Page 1 of 2 << [1] [2] >>

Profile

aillarionov: (Default)
Illarionov

April 2023

S M T W T F S
       1
2 34 5 67 8
9 10 11 12131415
1617 18 19 2021 22
23 2425 2627 2829
30      

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jun. 2nd, 2025 06:44 pm
Powered by Dreamwidth Studios